Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

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Length 73 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LINC00587B1AMM8 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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LINC00587B1AMM8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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LINC00587B1AMM8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
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LINC00587B1AMM8 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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