Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SNX13Q9Y5W8 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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SNX13Q9Y5W8 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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SNX13Q9Y5W8 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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SNX13Q9Y5W8 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
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SNX13Q9Y5W8 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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SNX13Q9Y5W8 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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SNX13Q9Y5W8 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SNX13Q9Y5W8 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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