Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX7Q9UNH6 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms