Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR7

CLEC4A, C-type lectin domain family 4 member A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4AQ9UMR7 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLEC4AQ9UMR7 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms