Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ1

TPCN1, Two pore calcium channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1Q9ULQ1 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TPCN1Q9ULQ1 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TPCN1Q9ULQ1 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TPCN1Q9ULQ1 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TPCN1Q9ULQ1 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TPCN1Q9ULQ1 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TPCN1Q9ULQ1 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TPCN1Q9ULQ1 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TPCN1Q9ULQ1 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TPCN1Q9ULQ1 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TPCN1Q9ULQ1 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TPCN1Q9ULQ1 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TPCN1Q9ULQ1 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TPCN1Q9ULQ1 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TPCN1Q9ULQ1 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TPCN1Q9ULQ1 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TPCN1Q9ULQ1 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TPCN1Q9ULQ1 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TPCN1Q9ULQ1 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TPCN1Q9ULQ1 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TPCN1Q9ULQ1 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TPCN1Q9ULQ1 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TPCN1Q9ULQ1 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TPCN1Q9ULQ1 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TPCN1Q9ULQ1 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TPCN1Q9ULQ1 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TPCN1Q9ULQ1 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TPCN1Q9ULQ1 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TPCN1Q9ULQ1 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TPCN1Q9ULQ1 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TPCN1Q9ULQ1 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TPCN1Q9ULQ1 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TPCN1Q9ULQ1 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TPCN1Q9ULQ1 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TPCN1Q9ULQ1 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TPCN1Q9ULQ1 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TPCN1Q9ULQ1 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TPCN1Q9ULQ1 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TPCN1Q9ULQ1 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TPCN1Q9ULQ1 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TPCN1Q9ULQ1 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TPCN1Q9ULQ1 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TPCN1Q9ULQ1 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TPCN1Q9ULQ1 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TPCN1Q9ULQ1 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TPCN1Q9ULQ1 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TPCN1Q9ULQ1 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TPCN1Q9ULQ1 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TPCN1Q9ULQ1 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TPCN1Q9ULQ1 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TPCN1Q9ULQ1 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TPCN1Q9ULQ1 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TPCN1Q9ULQ1 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TPCN1Q9ULQ1 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TPCN1Q9ULQ1 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TPCN1Q9ULQ1 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TPCN1Q9ULQ1 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TPCN1Q9ULQ1 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TPCN1Q9ULQ1 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TPCN1Q9ULQ1 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TPCN1Q9ULQ1 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TPCN1Q9ULQ1 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TPCN1Q9ULQ1 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TPCN1Q9ULQ1 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TPCN1Q9ULQ1 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TPCN1Q9ULQ1 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TPCN1Q9ULQ1 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
TPCN1Q9ULQ1 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TPCN1Q9ULQ1 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TPCN1Q9ULQ1 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TPCN1Q9ULQ1 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TPCN1Q9ULQ1 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TPCN1Q9ULQ1 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TPCN1Q9ULQ1 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TPCN1Q9ULQ1 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TPCN1Q9ULQ1 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TPCN1Q9ULQ1 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TPCN1Q9ULQ1 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TPCN1Q9ULQ1 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TPCN1Q9ULQ1 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TPCN1Q9ULQ1 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TPCN1Q9ULQ1 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TPCN1Q9ULQ1 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TPCN1Q9ULQ1 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TPCN1Q9ULQ1 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TPCN1Q9ULQ1 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TPCN1Q9ULQ1 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TPCN1Q9ULQ1 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TPCN1Q9ULQ1 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TPCN1Q9ULQ1 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TPCN1Q9ULQ1 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TPCN1Q9ULQ1 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TPCN1Q9ULQ1 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TPCN1Q9ULQ1 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TPCN1Q9ULQ1 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TPCN1Q9ULQ1 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TPCN1Q9ULQ1 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TPCN1Q9ULQ1 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TPCN1Q9ULQ1 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TPCN1Q9ULQ1 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms