Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG9

CROT, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROTQ9UKG9 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CROTQ9UKG9 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms