Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RPUSD1Q9UJJ7 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms