Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCN11AQ9UI33 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN11AQ9UI33 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms