Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNTNAP2Q9UHC6 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms