Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RDH8Q9NYR8 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms