Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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