Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLCO1B3Q9NPD5 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms