Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHARPINQ9H0F6 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms