Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN8

C20orf27, UPF0687 protein C20orf27, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf27Q9GZN8 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C20orf27Q9GZN8 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C20orf27Q9GZN8 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C20orf27Q9GZN8 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C20orf27Q9GZN8 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C20orf27Q9GZN8 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C20orf27Q9GZN8 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C20orf27Q9GZN8 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C20orf27Q9GZN8 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C20orf27Q9GZN8 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C20orf27Q9GZN8 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C20orf27Q9GZN8 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C20orf27Q9GZN8 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C20orf27Q9GZN8 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C20orf27Q9GZN8 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C20orf27Q9GZN8 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C20orf27Q9GZN8 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C20orf27Q9GZN8 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C20orf27Q9GZN8 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C20orf27Q9GZN8 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C20orf27Q9GZN8 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C20orf27Q9GZN8 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C20orf27Q9GZN8 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C20orf27Q9GZN8 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
C20orf27Q9GZN8 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C20orf27Q9GZN8 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C20orf27Q9GZN8 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C20orf27Q9GZN8 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C20orf27Q9GZN8 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C20orf27Q9GZN8 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C20orf27Q9GZN8 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C20orf27Q9GZN8 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C20orf27Q9GZN8 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C20orf27Q9GZN8 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
C20orf27Q9GZN8 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C20orf27Q9GZN8 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C20orf27Q9GZN8 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C20orf27Q9GZN8 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C20orf27Q9GZN8 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C20orf27Q9GZN8 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C20orf27Q9GZN8 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C20orf27Q9GZN8 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C20orf27Q9GZN8 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C20orf27Q9GZN8 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C20orf27Q9GZN8 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C20orf27Q9GZN8 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C20orf27Q9GZN8 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C20orf27Q9GZN8 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C20orf27Q9GZN8 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C20orf27Q9GZN8 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C20orf27Q9GZN8 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C20orf27Q9GZN8 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C20orf27Q9GZN8 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C20orf27Q9GZN8 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C20orf27Q9GZN8 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
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C20orf27Q9GZN8 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C20orf27Q9GZN8 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C20orf27Q9GZN8 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C20orf27Q9GZN8 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C20orf27Q9GZN8 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C20orf27Q9GZN8 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
C20orf27Q9GZN8 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
C20orf27Q9GZN8 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
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C20orf27Q9GZN8 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
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C20orf27Q9GZN8 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
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C20orf27Q9GZN8 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
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C20orf27Q9GZN8 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C20orf27Q9GZN8 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C20orf27Q9GZN8 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C20orf27Q9GZN8 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
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C20orf27Q9GZN8 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
C20orf27Q9GZN8 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
C20orf27Q9GZN8 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
C20orf27Q9GZN8 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
C20orf27Q9GZN8 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
C20orf27Q9GZN8 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
C20orf27Q9GZN8 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C20orf27Q9GZN8 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C20orf27Q9GZN8 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C20orf27Q9GZN8 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C20orf27Q9GZN8 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C20orf27Q9GZN8 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C20orf27Q9GZN8 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C20orf27Q9GZN8 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C20orf27Q9GZN8 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C20orf27Q9GZN8 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C20orf27Q9GZN8 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C20orf27Q9GZN8 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C20orf27Q9GZN8 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C20orf27Q9GZN8 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C20orf27Q9GZN8 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C20orf27Q9GZN8 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
C20orf27Q9GZN8 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C20orf27Q9GZN8 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
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