Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H9

SRCIN1, SRC kinase signaling inhibitor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCIN1Q9C0H9 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRCIN1Q9C0H9 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRCIN1Q9C0H9 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRCIN1Q9C0H9 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRCIN1Q9C0H9 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRCIN1Q9C0H9 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRCIN1Q9C0H9 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRCIN1Q9C0H9 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRCIN1Q9C0H9 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRCIN1Q9C0H9 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRCIN1Q9C0H9 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRCIN1Q9C0H9 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRCIN1Q9C0H9 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRCIN1Q9C0H9 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRCIN1Q9C0H9 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRCIN1Q9C0H9 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRCIN1Q9C0H9 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRCIN1Q9C0H9 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SRCIN1Q9C0H9 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRCIN1Q9C0H9 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRCIN1Q9C0H9 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRCIN1Q9C0H9 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRCIN1Q9C0H9 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRCIN1Q9C0H9 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SRCIN1Q9C0H9 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SRCIN1Q9C0H9 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRCIN1Q9C0H9 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRCIN1Q9C0H9 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRCIN1Q9C0H9 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRCIN1Q9C0H9 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRCIN1Q9C0H9 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRCIN1Q9C0H9 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRCIN1Q9C0H9 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRCIN1Q9C0H9 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRCIN1Q9C0H9 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRCIN1Q9C0H9 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRCIN1Q9C0H9 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRCIN1Q9C0H9 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRCIN1Q9C0H9 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRCIN1Q9C0H9 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRCIN1Q9C0H9 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRCIN1Q9C0H9 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRCIN1Q9C0H9 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SRCIN1Q9C0H9 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRCIN1Q9C0H9 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRCIN1Q9C0H9 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRCIN1Q9C0H9 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRCIN1Q9C0H9 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRCIN1Q9C0H9 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRCIN1Q9C0H9 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRCIN1Q9C0H9 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRCIN1Q9C0H9 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRCIN1Q9C0H9 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SRCIN1Q9C0H9 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SRCIN1Q9C0H9 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SRCIN1Q9C0H9 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRCIN1Q9C0H9 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRCIN1Q9C0H9 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRCIN1Q9C0H9 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRCIN1Q9C0H9 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRCIN1Q9C0H9 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRCIN1Q9C0H9 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRCIN1Q9C0H9 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRCIN1Q9C0H9 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRCIN1Q9C0H9 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRCIN1Q9C0H9 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRCIN1Q9C0H9 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRCIN1Q9C0H9 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SRCIN1Q9C0H9 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SRCIN1Q9C0H9 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SRCIN1Q9C0H9 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRCIN1Q9C0H9 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRCIN1Q9C0H9 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRCIN1Q9C0H9 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRCIN1Q9C0H9 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRCIN1Q9C0H9 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRCIN1Q9C0H9 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRCIN1Q9C0H9 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRCIN1Q9C0H9 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRCIN1Q9C0H9 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRCIN1Q9C0H9 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRCIN1Q9C0H9 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRCIN1Q9C0H9 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRCIN1Q9C0H9 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRCIN1Q9C0H9 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRCIN1Q9C0H9 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRCIN1Q9C0H9 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRCIN1Q9C0H9 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRCIN1Q9C0H9 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRCIN1Q9C0H9 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRCIN1Q9C0H9 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRCIN1Q9C0H9 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SRCIN1Q9C0H9 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRCIN1Q9C0H9 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRCIN1Q9C0H9 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRCIN1Q9C0H9 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRCIN1Q9C0H9 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRCIN1Q9C0H9 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRCIN1Q9C0H9 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRCIN1Q9C0H9 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms