Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PUS3Q9BZE2 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PUS3Q9BZE2 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PUS3Q9BZE2 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PUS3Q9BZE2 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PUS3Q9BZE2 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PUS3Q9BZE2 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PUS3Q9BZE2 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PUS3Q9BZE2 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PUS3Q9BZE2 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PUS3Q9BZE2 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PUS3Q9BZE2 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PUS3Q9BZE2 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PUS3Q9BZE2 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PUS3Q9BZE2 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PUS3Q9BZE2 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PUS3Q9BZE2 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PUS3Q9BZE2 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PUS3Q9BZE2 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PUS3Q9BZE2 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PUS3Q9BZE2 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PUS3Q9BZE2 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PUS3Q9BZE2 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PUS3Q9BZE2 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PUS3Q9BZE2 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PUS3Q9BZE2 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PUS3Q9BZE2 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PUS3Q9BZE2 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PUS3Q9BZE2 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PUS3Q9BZE2 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PUS3Q9BZE2 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PUS3Q9BZE2 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PUS3Q9BZE2 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PUS3Q9BZE2 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PUS3Q9BZE2 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PUS3Q9BZE2 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PUS3Q9BZE2 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PUS3Q9BZE2 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PUS3Q9BZE2 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PUS3Q9BZE2 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PUS3Q9BZE2 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PUS3Q9BZE2 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PUS3Q9BZE2 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PUS3Q9BZE2 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PUS3Q9BZE2 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PUS3Q9BZE2 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PUS3Q9BZE2 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PUS3Q9BZE2 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PUS3Q9BZE2 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PUS3Q9BZE2 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PUS3Q9BZE2 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PUS3Q9BZE2 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PUS3Q9BZE2 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PUS3Q9BZE2 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PUS3Q9BZE2 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PUS3Q9BZE2 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PUS3Q9BZE2 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PUS3Q9BZE2 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PUS3Q9BZE2 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PUS3Q9BZE2 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PUS3Q9BZE2 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PUS3Q9BZE2 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PUS3Q9BZE2 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PUS3Q9BZE2 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PUS3Q9BZE2 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PUS3Q9BZE2 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PUS3Q9BZE2 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PUS3Q9BZE2 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PUS3Q9BZE2 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PUS3Q9BZE2 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PUS3Q9BZE2 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PUS3Q9BZE2 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PUS3Q9BZE2 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PUS3Q9BZE2 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PUS3Q9BZE2 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PUS3Q9BZE2 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PUS3Q9BZE2 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PUS3Q9BZE2 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PUS3Q9BZE2 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PUS3Q9BZE2 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PUS3Q9BZE2 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PUS3Q9BZE2 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PUS3Q9BZE2 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PUS3Q9BZE2 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PUS3Q9BZE2 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PUS3Q9BZE2 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PUS3Q9BZE2 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PUS3Q9BZE2 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PUS3Q9BZE2 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PUS3Q9BZE2 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PUS3Q9BZE2 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PUS3Q9BZE2 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PUS3Q9BZE2 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PUS3Q9BZE2 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PUS3Q9BZE2 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PUS3Q9BZE2 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PUS3Q9BZE2 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PUS3Q9BZE2 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PUS3Q9BZE2 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PUS3Q9BZE2 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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