Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NICN1Q9BSH3 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NICN1Q9BSH3 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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