Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC22CQ9BRL7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms