Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms