Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW5

COG8, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG8Q96MW5 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
COG8Q96MW5 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms