Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SENP8Q96LD8 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SENP8Q96LD8 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SENP8Q96LD8 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SENP8Q96LD8 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SENP8Q96LD8 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SENP8Q96LD8 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SENP8Q96LD8 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SENP8Q96LD8 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SENP8Q96LD8 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SENP8Q96LD8 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SENP8Q96LD8 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SENP8Q96LD8 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SENP8Q96LD8 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SENP8Q96LD8 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SENP8Q96LD8 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SENP8Q96LD8 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SENP8Q96LD8 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SENP8Q96LD8 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SENP8Q96LD8 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SENP8Q96LD8 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SENP8Q96LD8 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SENP8Q96LD8 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SENP8Q96LD8 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SENP8Q96LD8 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SENP8Q96LD8 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SENP8Q96LD8 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SENP8Q96LD8 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SENP8Q96LD8 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SENP8Q96LD8 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SENP8Q96LD8 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SENP8Q96LD8 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SENP8Q96LD8 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SENP8Q96LD8 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SENP8Q96LD8 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SENP8Q96LD8 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SENP8Q96LD8 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SENP8Q96LD8 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SENP8Q96LD8 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SENP8Q96LD8 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SENP8Q96LD8 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SENP8Q96LD8 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SENP8Q96LD8 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SENP8Q96LD8 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SENP8Q96LD8 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SENP8Q96LD8 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SENP8Q96LD8 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SENP8Q96LD8 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SENP8Q96LD8 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SENP8Q96LD8 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SENP8Q96LD8 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SENP8Q96LD8 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SENP8Q96LD8 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SENP8Q96LD8 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SENP8Q96LD8 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SENP8Q96LD8 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SENP8Q96LD8 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SENP8Q96LD8 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SENP8Q96LD8 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SENP8Q96LD8 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SENP8Q96LD8 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SENP8Q96LD8 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SENP8Q96LD8 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SENP8Q96LD8 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SENP8Q96LD8 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SENP8Q96LD8 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SENP8Q96LD8 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SENP8Q96LD8 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SENP8Q96LD8 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SENP8Q96LD8 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SENP8Q96LD8 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SENP8Q96LD8 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SENP8Q96LD8 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SENP8Q96LD8 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SENP8Q96LD8 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SENP8Q96LD8 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SENP8Q96LD8 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SENP8Q96LD8 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SENP8Q96LD8 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SENP8Q96LD8 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SENP8Q96LD8 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SENP8Q96LD8 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SENP8Q96LD8 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SENP8Q96LD8 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SENP8Q96LD8 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SENP8Q96LD8 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SENP8Q96LD8 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SENP8Q96LD8 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SENP8Q96LD8 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SENP8Q96LD8 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SENP8Q96LD8 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SENP8Q96LD8 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SENP8Q96LD8 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SENP8Q96LD8 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SENP8Q96LD8 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SENP8Q96LD8 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SENP8Q96LD8 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SENP8Q96LD8 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SENP8Q96LD8 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SENP8Q96LD8 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms