Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SGCZQ96LD1 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SGCZQ96LD1 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SGCZQ96LD1 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SGCZQ96LD1 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SGCZQ96LD1 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SGCZQ96LD1 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SGCZQ96LD1 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SGCZQ96LD1 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SGCZQ96LD1 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SGCZQ96LD1 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SGCZQ96LD1 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SGCZQ96LD1 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SGCZQ96LD1 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SGCZQ96LD1 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SGCZQ96LD1 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SGCZQ96LD1 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SGCZQ96LD1 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SGCZQ96LD1 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SGCZQ96LD1 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SGCZQ96LD1 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SGCZQ96LD1 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCZQ96LD1 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms