Protein–RNA interactions for Protein: Q96ER9

CCDC51, Coiled-coil domain-containing protein 51, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC51Q96ER9 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC51Q96ER9 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC51Q96ER9 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC51Q96ER9 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC51Q96ER9 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC51Q96ER9 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC51Q96ER9 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC51Q96ER9 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC51Q96ER9 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC51Q96ER9 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC51Q96ER9 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC51Q96ER9 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC51Q96ER9 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC51Q96ER9 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC51Q96ER9 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC51Q96ER9 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC51Q96ER9 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC51Q96ER9 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC51Q96ER9 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC51Q96ER9 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC51Q96ER9 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC51Q96ER9 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC51Q96ER9 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC51Q96ER9 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC51Q96ER9 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC51Q96ER9 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC51Q96ER9 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC51Q96ER9 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC51Q96ER9 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC51Q96ER9 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC51Q96ER9 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC51Q96ER9 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC51Q96ER9 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC51Q96ER9 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC51Q96ER9 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC51Q96ER9 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC51Q96ER9 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC51Q96ER9 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC51Q96ER9 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC51Q96ER9 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC51Q96ER9 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC51Q96ER9 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC51Q96ER9 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC51Q96ER9 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC51Q96ER9 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC51Q96ER9 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC51Q96ER9 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC51Q96ER9 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC51Q96ER9 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC51Q96ER9 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC51Q96ER9 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC51Q96ER9 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC51Q96ER9 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC51Q96ER9 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC51Q96ER9 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC51Q96ER9 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC51Q96ER9 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC51Q96ER9 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC51Q96ER9 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC51Q96ER9 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC51Q96ER9 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC51Q96ER9 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC51Q96ER9 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC51Q96ER9 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC51Q96ER9 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC51Q96ER9 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC51Q96ER9 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC51Q96ER9 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC51Q96ER9 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC51Q96ER9 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC51Q96ER9 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC51Q96ER9 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC51Q96ER9 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC51Q96ER9 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC51Q96ER9 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC51Q96ER9 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC51Q96ER9 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC51Q96ER9 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC51Q96ER9 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC51Q96ER9 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC51Q96ER9 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC51Q96ER9 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC51Q96ER9 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC51Q96ER9 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC51Q96ER9 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC51Q96ER9 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC51Q96ER9 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC51Q96ER9 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC51Q96ER9 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC51Q96ER9 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC51Q96ER9 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC51Q96ER9 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC51Q96ER9 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC51Q96ER9 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC51Q96ER9 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC51Q96ER9 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC51Q96ER9 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC51Q96ER9 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC51Q96ER9 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC51Q96ER9 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85 ms