Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UTP4Q969X6 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms