Protein–RNA interactions for Protein: Q969K7

TMEM54, Transmembrane protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM54Q969K7 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM54Q969K7 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms