Protein–RNA interactions for Protein: Q92922

SMARCC1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCC1Q92922 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMARCC1Q92922 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms