Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TMIEQ8NEW7 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms