Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms