Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX29P2Q8IUI4 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX29P2Q8IUI4 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms