Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NUP54Q7Z3B4 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms