Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT89

SLC25A48, Solute carrier family 25 member 48, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A48Q6ZT89 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SLC25A48Q6ZT89 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SLC25A48Q6ZT89 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SLC25A48Q6ZT89 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SLC25A48Q6ZT89 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SLC25A48Q6ZT89 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SLC25A48Q6ZT89 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SLC25A48Q6ZT89 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SLC25A48Q6ZT89 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SLC25A48Q6ZT89 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SLC25A48Q6ZT89 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SLC25A48Q6ZT89 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SLC25A48Q6ZT89 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SLC25A48Q6ZT89 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SLC25A48Q6ZT89 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SLC25A48Q6ZT89 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SLC25A48Q6ZT89 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SLC25A48Q6ZT89 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SLC25A48Q6ZT89 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SLC25A48Q6ZT89 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SLC25A48Q6ZT89 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SLC25A48Q6ZT89 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SLC25A48Q6ZT89 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SLC25A48Q6ZT89 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SLC25A48Q6ZT89 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SLC25A48Q6ZT89 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SLC25A48Q6ZT89 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SLC25A48Q6ZT89 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SLC25A48Q6ZT89 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SLC25A48Q6ZT89 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SLC25A48Q6ZT89 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SLC25A48Q6ZT89 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SLC25A48Q6ZT89 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SLC25A48Q6ZT89 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SLC25A48Q6ZT89 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SLC25A48Q6ZT89 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SLC25A48Q6ZT89 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SLC25A48Q6ZT89 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SLC25A48Q6ZT89 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SLC25A48Q6ZT89 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SLC25A48Q6ZT89 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SLC25A48Q6ZT89 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC25A48Q6ZT89 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC25A48Q6ZT89 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC25A48Q6ZT89 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC25A48Q6ZT89 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC25A48Q6ZT89 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC25A48Q6ZT89 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC25A48Q6ZT89 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC25A48Q6ZT89 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC25A48Q6ZT89 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC25A48Q6ZT89 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC25A48Q6ZT89 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC25A48Q6ZT89 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC25A48Q6ZT89 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC25A48Q6ZT89 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC25A48Q6ZT89 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC25A48Q6ZT89 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC25A48Q6ZT89 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC25A48Q6ZT89 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC25A48Q6ZT89 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC25A48Q6ZT89 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC25A48Q6ZT89 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC25A48Q6ZT89 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC25A48Q6ZT89 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC25A48Q6ZT89 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC25A48Q6ZT89 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC25A48Q6ZT89 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC25A48Q6ZT89 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC25A48Q6ZT89 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC25A48Q6ZT89 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC25A48Q6ZT89 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC25A48Q6ZT89 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC25A48Q6ZT89 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC25A48Q6ZT89 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC25A48Q6ZT89 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC25A48Q6ZT89 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC25A48Q6ZT89 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC25A48Q6ZT89 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC25A48Q6ZT89 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC25A48Q6ZT89 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC25A48Q6ZT89 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC25A48Q6ZT89 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC25A48Q6ZT89 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC25A48Q6ZT89 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC25A48Q6ZT89 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC25A48Q6ZT89 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC25A48Q6ZT89 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC25A48Q6ZT89 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC25A48Q6ZT89 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC25A48Q6ZT89 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC25A48Q6ZT89 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC25A48Q6ZT89 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC25A48Q6ZT89 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC25A48Q6ZT89 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC25A48Q6ZT89 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC25A48Q6ZT89 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC25A48Q6ZT89 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC25A48Q6ZT89 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC25A48Q6ZT89 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms