Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRZ4

C9orf47, Uncharacterized protein C9orf47, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47Q6ZRZ4 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
C9orf47Q6ZRZ4 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf47Q6ZRZ4 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf47Q6ZRZ4 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf47Q6ZRZ4 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf47Q6ZRZ4 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf47Q6ZRZ4 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf47Q6ZRZ4 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf47Q6ZRZ4 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf47Q6ZRZ4 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf47Q6ZRZ4 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf47Q6ZRZ4 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf47Q6ZRZ4 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf47Q6ZRZ4 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf47Q6ZRZ4 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf47Q6ZRZ4 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf47Q6ZRZ4 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf47Q6ZRZ4 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf47Q6ZRZ4 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf47Q6ZRZ4 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf47Q6ZRZ4 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf47Q6ZRZ4 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf47Q6ZRZ4 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf47Q6ZRZ4 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf47Q6ZRZ4 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf47Q6ZRZ4 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf47Q6ZRZ4 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf47Q6ZRZ4 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf47Q6ZRZ4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf47Q6ZRZ4 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf47Q6ZRZ4 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf47Q6ZRZ4 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf47Q6ZRZ4 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf47Q6ZRZ4 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf47Q6ZRZ4 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms