Protein–RNA interactions for Protein: Q6VVB1

NHLRC1, E3 ubiquitin-protein ligase NHLRC1, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC1Q6VVB1 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NHLRC1Q6VVB1 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms