Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXD1

HRCT1, Histidine-rich carboxyl terminus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCT1Q6UXD1 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HRCT1Q6UXD1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms