Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms