Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL7

FNDC7, Fibronectin type III domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC7Q5VTL7 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FNDC7Q5VTL7 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FNDC7Q5VTL7 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FNDC7Q5VTL7 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FNDC7Q5VTL7 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms