Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BRMS1LQ5PSV4 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms