Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms