Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYTL3Q4VX76 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYTL3Q4VX76 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYTL3Q4VX76 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SYTL3Q4VX76 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYTL3Q4VX76 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYTL3Q4VX76 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYTL3Q4VX76 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYTL3Q4VX76 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYTL3Q4VX76 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYTL3Q4VX76 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYTL3Q4VX76 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYTL3Q4VX76 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYTL3Q4VX76 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYTL3Q4VX76 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYTL3Q4VX76 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYTL3Q4VX76 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SYTL3Q4VX76 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYTL3Q4VX76 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SYTL3Q4VX76 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYTL3Q4VX76 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYTL3Q4VX76 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYTL3Q4VX76 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYTL3Q4VX76 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYTL3Q4VX76 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYTL3Q4VX76 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYTL3Q4VX76 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYTL3Q4VX76 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYTL3Q4VX76 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYTL3Q4VX76 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYTL3Q4VX76 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYTL3Q4VX76 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYTL3Q4VX76 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYTL3Q4VX76 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYTL3Q4VX76 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYTL3Q4VX76 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYTL3Q4VX76 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYTL3Q4VX76 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYTL3Q4VX76 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYTL3Q4VX76 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYTL3Q4VX76 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYTL3Q4VX76 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYTL3Q4VX76 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYTL3Q4VX76 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYTL3Q4VX76 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYTL3Q4VX76 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYTL3Q4VX76 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYTL3Q4VX76 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SYTL3Q4VX76 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SYTL3Q4VX76 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SYTL3Q4VX76 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SYTL3Q4VX76 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYTL3Q4VX76 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYTL3Q4VX76 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYTL3Q4VX76 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYTL3Q4VX76 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYTL3Q4VX76 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYTL3Q4VX76 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYTL3Q4VX76 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYTL3Q4VX76 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYTL3Q4VX76 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYTL3Q4VX76 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYTL3Q4VX76 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYTL3Q4VX76 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SYTL3Q4VX76 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYTL3Q4VX76 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYTL3Q4VX76 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYTL3Q4VX76 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYTL3Q4VX76 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYTL3Q4VX76 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SYTL3Q4VX76 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SYTL3Q4VX76 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SYTL3Q4VX76 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SYTL3Q4VX76 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SYTL3Q4VX76 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYTL3Q4VX76 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SYTL3Q4VX76 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYTL3Q4VX76 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYTL3Q4VX76 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYTL3Q4VX76 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYTL3Q4VX76 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYTL3Q4VX76 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYTL3Q4VX76 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYTL3Q4VX76 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYTL3Q4VX76 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYTL3Q4VX76 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYTL3Q4VX76 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYTL3Q4VX76 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYTL3Q4VX76 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYTL3Q4VX76 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYTL3Q4VX76 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYTL3Q4VX76 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYTL3Q4VX76 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYTL3Q4VX76 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYTL3Q4VX76 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYTL3Q4VX76 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYTL3Q4VX76 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYTL3Q4VX76 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYTL3Q4VX76 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYTL3Q4VX76 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms