Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RNF212Q495C1 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RNF212Q495C1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RNF212Q495C1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RNF212Q495C1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RNF212Q495C1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
RNF212Q495C1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RNF212Q495C1 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RNF212Q495C1 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RNF212Q495C1 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RNF212Q495C1 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RNF212Q495C1 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RNF212Q495C1 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RNF212Q495C1 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RNF212Q495C1 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RNF212Q495C1 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RNF212Q495C1 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RNF212Q495C1 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RNF212Q495C1 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RNF212Q495C1 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RNF212Q495C1 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RNF212Q495C1 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RNF212Q495C1 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RNF212Q495C1 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RNF212Q495C1 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RNF212Q495C1 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RNF212Q495C1 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RNF212Q495C1 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RNF212Q495C1 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RNF212Q495C1 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
RNF212Q495C1 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RNF212Q495C1 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RNF212Q495C1 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RNF212Q495C1 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RNF212Q495C1 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RNF212Q495C1 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RNF212Q495C1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RNF212Q495C1 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RNF212Q495C1 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RNF212Q495C1 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RNF212Q495C1 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RNF212Q495C1 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RNF212Q495C1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RNF212Q495C1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RNF212Q495C1 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RNF212Q495C1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RNF212Q495C1 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RNF212Q495C1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RNF212Q495C1 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RNF212Q495C1 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RNF212Q495C1 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RNF212Q495C1 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RNF212Q495C1 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RNF212Q495C1 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RNF212Q495C1 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RNF212Q495C1 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RNF212Q495C1 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RNF212Q495C1 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RNF212Q495C1 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RNF212Q495C1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RNF212Q495C1 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
RNF212Q495C1 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RNF212Q495C1 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RNF212Q495C1 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RNF212Q495C1 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RNF212Q495C1 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RNF212Q495C1 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
RNF212Q495C1 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
RNF212Q495C1 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
RNF212Q495C1 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
RNF212Q495C1 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RNF212Q495C1 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RNF212Q495C1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RNF212Q495C1 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RNF212Q495C1 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RNF212Q495C1 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RNF212Q495C1 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RNF212Q495C1 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RNF212Q495C1 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RNF212Q495C1 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RNF212Q495C1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RNF212Q495C1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RNF212Q495C1 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RNF212Q495C1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RNF212Q495C1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RNF212Q495C1 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RNF212Q495C1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RNF212Q495C1 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RNF212Q495C1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RNF212Q495C1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RNF212Q495C1 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RNF212Q495C1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RNF212Q495C1 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RNF212Q495C1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RNF212Q495C1 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RNF212Q495C1 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RNF212Q495C1 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RNF212Q495C1 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RNF212Q495C1 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RNF212Q495C1 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms