Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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CCDC96Q2M329 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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CCDC96Q2M329 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC96Q2M329 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
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