Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q1T7F1 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q1T7F1 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q1T7F1 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q1T7F1 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q1T7F1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q1T7F1 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q1T7F1 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q1T7F1 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q1T7F1 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q1T7F1 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q1T7F1 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q1T7F1 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q1T7F1 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q1T7F1 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q1T7F1 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q1T7F1 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.88
Q1T7F1 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
Q1T7F1 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q1T7F1 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q1T7F1 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q1T7F1 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q1T7F1 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q1T7F1 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Q1T7F1 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q1T7F1 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q1T7F1 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q1T7F1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q1T7F1 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q1T7F1 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q1T7F1 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Q1T7F1 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q1T7F1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q1T7F1 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q1T7F1 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Q1T7F1 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q1T7F1 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q1T7F1 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q1T7F1 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q1T7F1 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q1T7F1 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q1T7F1 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q1T7F1 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q1T7F1 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q1T7F1 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q1T7F1 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q1T7F1 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q1T7F1 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q1T7F1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q1T7F1 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q1T7F1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q1T7F1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q1T7F1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q1T7F1 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q1T7F1 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q1T7F1 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q1T7F1 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q1T7F1 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q1T7F1 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q1T7F1 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q1T7F1 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q1T7F1 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q1T7F1 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q1T7F1 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q1T7F1 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q1T7F1 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Q1T7F1 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q1T7F1 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q1T7F1 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q1T7F1 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q1T7F1 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q1T7F1 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q1T7F1 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q1T7F1 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q1T7F1 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q1T7F1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q1T7F1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q1T7F1 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q1T7F1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q1T7F1 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q1T7F1 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q1T7F1 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q1T7F1 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q1T7F1 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q1T7F1 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q1T7F1 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q1T7F1 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q1T7F1 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q1T7F1 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q1T7F1 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Q1T7F1 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q1T7F1 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q1T7F1 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q1T7F1 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q1T7F1 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q1T7F1 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q1T7F1 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q1T7F1 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q1T7F1 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q1T7F1 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
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