Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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