Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SF1Q15637 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SF1Q15637 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SF1Q15637 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SF1Q15637 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SF1Q15637 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SF1Q15637 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SF1Q15637 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SF1Q15637 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SF1Q15637 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SF1Q15637 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SF1Q15637 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SF1Q15637 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SF1Q15637 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SF1Q15637 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SF1Q15637 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SF1Q15637 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SF1Q15637 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SF1Q15637 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SF1Q15637 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SF1Q15637 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SF1Q15637 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SF1Q15637 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SF1Q15637 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SF1Q15637 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SF1Q15637 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SF1Q15637 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SF1Q15637 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SF1Q15637 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SF1Q15637 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SF1Q15637 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SF1Q15637 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SF1Q15637 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SF1Q15637 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SF1Q15637 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SF1Q15637 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SF1Q15637 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SF1Q15637 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SF1Q15637 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SF1Q15637 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SF1Q15637 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SF1Q15637 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SF1Q15637 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SF1Q15637 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SF1Q15637 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SF1Q15637 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SF1Q15637 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SF1Q15637 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SF1Q15637 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SF1Q15637 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SF1Q15637 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SF1Q15637 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SF1Q15637 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SF1Q15637 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SF1Q15637 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SF1Q15637 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SF1Q15637 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SF1Q15637 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SF1Q15637 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SF1Q15637 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SF1Q15637 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SF1Q15637 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SF1Q15637 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SF1Q15637 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SF1Q15637 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SF1Q15637 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SF1Q15637 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SF1Q15637 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SF1Q15637 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SF1Q15637 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SF1Q15637 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SF1Q15637 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SF1Q15637 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SF1Q15637 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SF1Q15637 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SF1Q15637 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SF1Q15637 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SF1Q15637 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SF1Q15637 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SF1Q15637 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SF1Q15637 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SF1Q15637 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SF1Q15637 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SF1Q15637 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SF1Q15637 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SF1Q15637 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SF1Q15637 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SF1Q15637 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SF1Q15637 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SF1Q15637 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SF1Q15637 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SF1Q15637 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SF1Q15637 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SF1Q15637 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SF1Q15637 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SF1Q15637 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SF1Q15637 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SF1Q15637 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SF1Q15637 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SF1Q15637 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
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