Protein–RNA interactions for Protein: Q15464

SHB, SH2 domain-containing adapter protein B, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHBQ15464 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHBQ15464 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHBQ15464 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHBQ15464 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHBQ15464 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHBQ15464 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHBQ15464 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHBQ15464 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHBQ15464 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHBQ15464 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHBQ15464 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHBQ15464 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHBQ15464 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SHBQ15464 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHBQ15464 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SHBQ15464 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHBQ15464 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHBQ15464 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SHBQ15464 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SHBQ15464 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SHBQ15464 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHBQ15464 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHBQ15464 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHBQ15464 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHBQ15464 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHBQ15464 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHBQ15464 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHBQ15464 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHBQ15464 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHBQ15464 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHBQ15464 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHBQ15464 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHBQ15464 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHBQ15464 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHBQ15464 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHBQ15464 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHBQ15464 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHBQ15464 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHBQ15464 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHBQ15464 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHBQ15464 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHBQ15464 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHBQ15464 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHBQ15464 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SHBQ15464 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHBQ15464 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHBQ15464 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SHBQ15464 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHBQ15464 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SHBQ15464 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SHBQ15464 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHBQ15464 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHBQ15464 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHBQ15464 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SHBQ15464 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHBQ15464 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHBQ15464 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHBQ15464 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHBQ15464 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHBQ15464 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHBQ15464 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHBQ15464 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHBQ15464 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHBQ15464 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHBQ15464 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHBQ15464 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHBQ15464 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHBQ15464 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHBQ15464 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHBQ15464 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHBQ15464 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHBQ15464 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SHBQ15464 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SHBQ15464 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHBQ15464 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHBQ15464 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHBQ15464 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHBQ15464 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHBQ15464 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHBQ15464 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHBQ15464 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHBQ15464 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHBQ15464 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHBQ15464 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHBQ15464 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHBQ15464 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHBQ15464 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHBQ15464 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHBQ15464 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SHBQ15464 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHBQ15464 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHBQ15464 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHBQ15464 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHBQ15464 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHBQ15464 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHBQ15464 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHBQ15464 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHBQ15464 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHBQ15464 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHBQ15464 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms