Protein–RNA interactions for Protein: Q15257

PTPA, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPAQ15257 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPAQ15257 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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