Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NCAPHQ15003 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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