Protein–RNA interactions for Protein: Q14781

CBX2, Chromobox protein homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX2Q14781 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CBX2Q14781 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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