Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTTNQ14247 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTTNQ14247 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTTNQ14247 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTTNQ14247 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTTNQ14247 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTTNQ14247 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTTNQ14247 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTTNQ14247 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTTNQ14247 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTTNQ14247 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTTNQ14247 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTTNQ14247 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTTNQ14247 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTTNQ14247 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTTNQ14247 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTTNQ14247 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTTNQ14247 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTTNQ14247 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTTNQ14247 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTTNQ14247 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTTNQ14247 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTTNQ14247 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTTNQ14247 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTTNQ14247 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTTNQ14247 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTTNQ14247 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTTNQ14247 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTTNQ14247 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTTNQ14247 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTTNQ14247 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTTNQ14247 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTTNQ14247 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTTNQ14247 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTTNQ14247 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTTNQ14247 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTTNQ14247 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTTNQ14247 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTTNQ14247 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTTNQ14247 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTTNQ14247 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTTNQ14247 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTTNQ14247 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTTNQ14247 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTTNQ14247 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTTNQ14247 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTTNQ14247 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTTNQ14247 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTTNQ14247 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTTNQ14247 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTTNQ14247 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTTNQ14247 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTTNQ14247 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTTNQ14247 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTTNQ14247 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTTNQ14247 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTTNQ14247 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CTTNQ14247 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTTNQ14247 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTTNQ14247 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTTNQ14247 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTTNQ14247 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTTNQ14247 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTTNQ14247 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTTNQ14247 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTTNQ14247 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTTNQ14247 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTTNQ14247 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTTNQ14247 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTTNQ14247 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTTNQ14247 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTTNQ14247 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTTNQ14247 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTTNQ14247 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTTNQ14247 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTTNQ14247 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CTTNQ14247 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTTNQ14247 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTTNQ14247 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CTTNQ14247 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTTNQ14247 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTTNQ14247 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CTTNQ14247 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTTNQ14247 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTTNQ14247 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTTNQ14247 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTTNQ14247 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTTNQ14247 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CTTNQ14247 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CTTNQ14247 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CTTNQ14247 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CTTNQ14247 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CTTNQ14247 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CTTNQ14247 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTTNQ14247 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTTNQ14247 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTTNQ14247 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTTNQ14247 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTTNQ14247 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTTNQ14247 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms