Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms